Le choléra (Vibrio cholerae) est endémique en Afrique australe et éclate fréquemment sous forme d'épidémies le long de la côte est. Des ressources considérables sont consacrées à la lutte contre le choléra, mais celui-ci reste un problème important. Des ressources limitées pourraient être mieux affectées à la prévention des épidémies s’il était possible d’évaluer le risque d’épidémie dans l’espace et dans le temps. Le CSIR en Afrique du Sud étudie les technologies permettant de prédire les risques sanitaires conformément aux priorités nationales. Cet article décrit un prototype d'outil SIG d'alerte précoce visant à identifier les conditions préalables favorables aux épidémies de choléra. Ces conditions préalables ont été définies à l’aide d’une approche système expert. Les variables ainsi identifiées ont été entrées dans un modèle spatial de logique floue qui génère des risques.

Le modèle repose sur l'hypothèse selon laquelle des réservoirs endémiques de choléra existent et que les conditions environnementales, en particulier la prolifération d'algues, déclenchent la croissance de Vibrio dans l'environnement naturel. Si les conditions préalables sont remplies, la propagation ultérieure du choléra dépend principalement de facteurs socio-économiques tels que le comportement humain et l’accès à l’approvisionnement en eau potable et à l’assainissement. Cet article se concentre sur les conditions préalables environnementales. La méthodologie décrite repose sur la capture de connaissances d'experts et de données historiques qui intègrent des paramètres climatiques et biophysiques avec des données épidémiologiques pour produire une surface floue du potentiel de risque d'épidémie de choléra.